Protein–RNA interactions for Protein: P13609

Srgn, Serglycin, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrgnP13609 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm13375-201ENSMUST00000126967 854 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Rhox7a-201ENSMUST00000096454 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Cep55-203ENSMUST00000169673 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Gm44596-201ENSMUST00000204223 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
SrgnP13609 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.7 ms