Protein–RNA interactions for Protein: P11370

Fv4, Retrovirus-related Env polyprotein from Fv-4 locus, mousemouse

Predictions only

Length 679 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fv4P11370 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pqlc3-208ENSMUST00000222203 1706 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Myb-203ENSMUST00000188495 3693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Fv4P11370 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fv4P11370 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Fv4P11370 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms