Protein–RNA interactions for Protein: P11369

Pol, LINE-1 retrotransposable element ORF2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PolP11369 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PolP11369 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
PolP11369 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
PolP11369 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
PolP11369 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
PolP11369 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms