Protein–RNA interactions for Protein: P10856

Tnp1, Spermatid nuclear transition protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 55 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnp1P10856 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ccno-201ENSMUST00000038404 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ptprk-203ENSMUST00000218359 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Rpap1-203ENSMUST00000110793 5458 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ppfia4-205ENSMUST00000189361 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Tmem8b-201ENSMUST00000107864 4726 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Kdm2b-202ENSMUST00000046073 5180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Dcaf17-209ENSMUST00000154704 7739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Dpysl5-201ENSMUST00000088081 5022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 2900026A02Rik-203ENSMUST00000212276 5864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Cd109-201ENSMUST00000093812 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.35□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Myo18a-207ENSMUST00000102488 7409 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Phactr1-213ENSMUST00000148891 5307 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Kctd3-201ENSMUST00000085678 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Atp13a2-201ENSMUST00000037055 3956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Sdad1-201ENSMUST00000031364 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC6.34□□□□□ -1.39
Tnp1P10856 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC6.34□□□□□ -1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms