Protein–RNA interactions for Protein: P10820

Prf1, Perforin-1, mousemouse

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prf1P10820 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Lcat-201ENSMUST00000038896 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gstz1-205ENSMUST00000222885 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Prf1P10820 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Prf1P10820 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms