Protein–RNA interactions for Protein: P0DN90

Tmem254b, Transmembrane protein 254b, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem254bP0DN90 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ip6k1-201ENSMUST00000035214 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Lancl1-202ENSMUST00000113979 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ptk2-202ENSMUST00000170939 3598 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gtse1-201ENSMUST00000170629 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hif1a-201ENSMUST00000021530 4724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Npas3-204ENSMUST00000223358 3143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tspyl1-201ENSMUST00000061372 3086 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zfp219-201ENSMUST00000067549 2933 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Col6a2-202ENSMUST00000105413 4653 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sema3d-201ENSMUST00000030868 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mpped1-203ENSMUST00000109470 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 C77080-203ENSMUST00000106051 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 C77080-202ENSMUST00000097873 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sertad2-203ENSMUST00000109586 5515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ppp2r5e-205ENSMUST00000220035 3135 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fnbp4-201ENSMUST00000013759 4691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm16796-201ENSMUST00000126086 3172 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm42688-201ENSMUST00000101253 3628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 C230004F18Rik-203ENSMUST00000137153 2138 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hoxa3-201ENSMUST00000114434 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fubp1-206ENSMUST00000196739 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hoxc4-201ENSMUST00000100164 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Epha1-201ENSMUST00000073387 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rara-203ENSMUST00000107474 2380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cpne1-203ENSMUST00000109608 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Plxnb2-202ENSMUST00000109331 6377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mrap2-202ENSMUST00000113149 2112 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Fam46a-201ENSMUST00000034802 5479 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Bcan-201ENSMUST00000090971 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Tomm34-202ENSMUST00000109384 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Rbm7-202ENSMUST00000213276 2629 ntTSL 2 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ubqln1-201ENSMUST00000058735 3686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Dennd6b-201ENSMUST00000078953 4607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Tmem254bP0DN90 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.91□□□□□ -0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms