Protein–RNA interactions for Protein: P08228

Sod1, Superoxide dismutase [Cu-Zn], mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 154 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sod1P08228 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Gm43474-201ENSMUST00000196415 774 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Atp6v0c-202ENSMUST00000098862 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Ntng1-203ENSMUST00000106570 1386 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Mmab-203ENSMUST00000123256 1277 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Gm43397-201ENSMUST00000196422 481 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Sod1P08228 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Parp16-205ENSMUST00000216702 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Lpar5-203ENSMUST00000171989 1458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Il15ra-206ENSMUST00000114834 784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm10499-201ENSMUST00000174094 934 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm13410-201ENSMUST00000117058 1415 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Arf5-201ENSMUST00000020717 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Sod1P08228 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms