Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rsu1-202ENSMUST00000114791 1604 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Twf2-204ENSMUST00000188650 1508 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm26681-201ENSMUST00000180851 1440 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm5184-201ENSMUST00000220417 1702 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm13829-201ENSMUST00000119600 138 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Cdk2ap2-204ENSMUST00000174514 669 ntTSL 2 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Il31-203ENSMUST00000198901 984 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 1700128F08Rik-202ENSMUST00000213708 717 ntBASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Olfr750-201ENSMUST00000048478 1132 ntAPPRIS P1 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Lsp1-203ENSMUST00000105966 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ywhaq-201ENSMUST00000049531 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Tssc4-201ENSMUST00000060433 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Nfix-203ENSMUST00000109762 2261 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Fbxo8-202ENSMUST00000110322 1709 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Fam172a-203ENSMUST00000163257 1436 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Mok-202ENSMUST00000070565 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Nt5c3b-201ENSMUST00000092688 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Krtap16-3-201ENSMUST00000179707 601 ntAPPRIS P1 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm37933-201ENSMUST00000193964 981 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Zfyve21-206ENSMUST00000222843 705 ntTSL 3 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Dmkn-201ENSMUST00000041703 662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Swi5-201ENSMUST00000050410 775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rnf25-201ENSMUST00000027357 1479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Erdr1-204ENSMUST00000179483 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Tspan3-203ENSMUST00000215906 842 ntTSL 3 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Mrpl36-201ENSMUST00000022098 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rpsa-ps10-201ENSMUST00000057740 885 ntBASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Olfr463-201ENSMUST00000081417 936 ntAPPRIS P1 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Zfyve19-202ENSMUST00000102519 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Eldr-203ENSMUST00000130392 1540 ntTSL 2 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm9803-202ENSMUST00000216543 456 ntTSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Egr1P08046 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms