Protein–RNA interactions for Protein: P01747

Ig heavy chain V region 36-65, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01747 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
P01747 Gfod1-201ENSMUST00000055341 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Ier5-201ENSMUST00000055322 3276 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
P01747 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Tbc1d20-201ENSMUST00000028963 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
P01747 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
P01747 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
P01747 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms