Protein–RNA interactions for Protein: P01668

Ig kappa chain V-III region PC 7210, mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01668 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
P01668 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
P01668 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Rps15-ps2-201ENSMUST00000121788 438 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
P01668 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Gss-201ENSMUST00000079691 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
P01668 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Acvrl1-204ENSMUST00000120028 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Iqcb1-201ENSMUST00000023535 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
P01668 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms