Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01652 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01652 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01652 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01652 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms