Protein–RNA interactions for Protein: P01649

Ig kappa chain V-V regions, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01649 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01649 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01649 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
P01649 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
P01649 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
P01649 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
P01649 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms