Protein–RNA interactions for Protein: P01641

Ig kappa chain V-V region MOPC 173B, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01641 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Ddx49-201ENSMUST00000008004 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 1700012D14Rik-201ENSMUST00000209597 605 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
P01641 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 A830018L16Rik-201ENSMUST00000048613 2779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Disc1-205ENSMUST00000117658 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Pi4k2a-201ENSMUST00000066778 3771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
P01641 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Ccdc158-204ENSMUST00000151180 3352 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
P01641 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
P01641 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Grk6-207ENSMUST00000225925 2769 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Tmem200c-201ENSMUST00000178545 3213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 BC028777-201ENSMUST00000137883 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
P01641 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 202.3 ms