Protein–RNA interactions for Protein: O89093

Ccl20, C-C motif chemokine 20, mousemouse

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Length 97 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl20O89093 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC13.75□□□□□ -0.21
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Ccl20O89093 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.75□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccl20O89093 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
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Ccl20O89093 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Adck2-201ENSMUST00000051249 2287 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Ccl20O89093 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
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