Protein–RNA interactions for Protein: O88978

Lrrc6, Protein tilB homolog, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc6O88978 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc6O88978 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc6O88978 Capn12-201ENSMUST00000066880 3040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc6O88978 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc6O88978 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc6O88978 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Lrrc6O88978 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Mospd2-201ENSMUST00000004715 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Sra1-205ENSMUST00000173875 2360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Slc18b1-206ENSMUST00000179321 2843 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Foxa1-201ENSMUST00000044380 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Galnt14-201ENSMUST00000024858 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gm15559-201ENSMUST00000132267 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 4833422C13Rik-201ENSMUST00000099331 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Wdtc1-202ENSMUST00000105906 4057 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Lrrc6O88978 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms