Protein–RNA interactions for Protein: O70361

Per3, Period circadian protein homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Per3O70361 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per3O70361 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Per3O70361 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Per3O70361 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Per3O70361 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Per3O70361 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Per3O70361 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Per3O70361 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Per3O70361 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Per3O70361 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Per3O70361 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.4 ms