Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Fam169b-206ENSMUST00000210558 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Sema6c-213ENSMUST00000168321 3553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Rasa4-201ENSMUST00000042135 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Vldlr-202ENSMUST00000047645 3260 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Myo9b-203ENSMUST00000170242 7297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
E2f6O54917 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 6530402F18Rik-203ENSMUST00000155949 4301 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Scyl1-201ENSMUST00000025890 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Rgl1-203ENSMUST00000111859 5092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Hgfac-201ENSMUST00000030985 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
E2f6O54917 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49 ms