Protein–RNA interactions for Protein: O54891

Lgals6, Galectin-6, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgals6O54891 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Pde4dip-205ENSMUST00000168438 8264 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Timp4-201ENSMUST00000032462 5496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nrap-201ENSMUST00000040711 5334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Zhx3-203ENSMUST00000109460 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Frmpd4-204ENSMUST00000112149 8456 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dlat-201ENSMUST00000034567 4035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rest-202ENSMUST00000113449 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Plch2-210ENSMUST00000176194 5619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Grin2a-202ENSMUST00000115835 5023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Adam22-207ENSMUST00000115388 9161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Hlcs-202ENSMUST00000163193 5371 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Spock2-201ENSMUST00000121820 5238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
Lgals6O54891 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms