Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
DffaO54786 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Hip1r-201ENSMUST00000000939 6735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Msl2-201ENSMUST00000085177 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
DffaO54786 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Dnajc1-209ENSMUST00000166495 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
DffaO54786 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms