Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 A530058N18Rik-205ENSMUST00000143993 550 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
EdaO54693 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Olfr1410-201ENSMUST00000079790 969 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
EdaO54693 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
EdaO54693 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EdaO54693 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EdaO54693 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
EdaO54693 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Lrr1-201ENSMUST00000110621 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
EdaO54693 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms