Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 SARDH-201ENST00000298628 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
DENRO43583 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 TERF1P5-201ENST00000477545 1207 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 C2orf69P4-201ENST00000565394 541 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
DENRO43583 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DENRO43583 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DENRO43583 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
DENRO43583 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DENRO43583 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
DENRO43583 PTPRU-202ENST00000373779 5579 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
DENRO43583 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 RAP1B-202ENST00000341355 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 NRBP2-202ENST00000442628 3587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
DENRO43583 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
DENRO43583 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms