Protein–RNA interactions for Protein: O35943

Fxn, Frataxin, mitochondrial, mousemouse

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Length 207 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FxnO35943 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
FxnO35943 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
FxnO35943 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FxnO35943 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FxnO35943 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
FxnO35943 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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FxnO35943 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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