Protein–RNA interactions for Protein: O35493

Clk4, Dual specificity protein kinase CLK4, mousemouse

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Length 481 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clk4O35493 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Car10-203ENSMUST00000107858 2742 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Dffb-201ENSMUST00000030893 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk4O35493 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk4O35493 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk4O35493 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk4O35493 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Zfp36l1-201ENSMUST00000021552 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
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Clk4O35493 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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Clk4O35493 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Clk4O35493 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms