Protein–RNA interactions for Protein: O09161

Casq2, Calsequestrin-2, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Casq2O09161 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gtf2h5-201ENSMUST00000039487 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq2O09161 E430024P14Rik-202ENSMUST00000160177 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Grn-201ENSMUST00000049460 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Agfg1-201ENSMUST00000063380 2896 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Hars-201ENSMUST00000001416 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Casq2O09161 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Maea-201ENSMUST00000114449 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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Casq2O09161 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Rgs3-201ENSMUST00000065870 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Usp1-201ENSMUST00000030289 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Mettl22-201ENSMUST00000046470 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Agbl5-202ENSMUST00000114700 3296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Impad1-201ENSMUST00000084949 6543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Casq2O09161 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69 ms