Protein–RNA interactions for Protein: O08665

Sema3a, Semaphorin-3A, mousemouse

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Length 772 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema3aO08665 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 4931440P22Rik-202ENSMUST00000147424 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.14
Sema3aO08665 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Nrg1-218ENSMUST00000209107 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Sema3aO08665 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.3 ms