Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Wwox-207ENSMUST00000160862 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Efna5O08543 B4galt3-201ENSMUST00000064272 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm7669-201ENSMUST00000210184 1603 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm40977-203ENSMUST00000222324 886 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Nap1l1-206ENSMUST00000219143 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Efna5O08543 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna5O08543 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 E430018J23Rik-201ENSMUST00000074249 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Efna5O08543 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.6 ms