Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 Ccl27a-202ENSMUST00000108032 350 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Scara3-201ENSMUST00000042046 3597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Usp35M0QWN7 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms