Protein–RNA interactions for Protein: L7N257

BC117090, cDNA sequence BC1179090, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC117090L7N257 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Atp13a3-202ENSMUST00000100013 7310 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Kif17-201ENSMUST00000030539 3453 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Afg3l2-201ENSMUST00000025408 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Rap2b-201ENSMUST00000049064 6793 ntAPPRIS P1 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Satb2-201ENSMUST00000042857 6277 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
BC117090L7N257 Kpnb1-201ENSMUST00000001479 5894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
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BC117090L7N257 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Clec16a-211ENSMUST00000155633 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
BC117090L7N257 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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BC117090L7N257 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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