Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

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Length 315 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3415J3QMS8 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3415J3QMS8 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3415J3QMS8 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
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Gm3415J3QMS8 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Gm3415J3QMS8 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Pspc1-202ENSMUST00000163924 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Gm3415J3QMS8 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.27
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