Protein–RNA interactions for Protein: J3QJW5

Cldn34c3, Claudin 34C3, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c3J3QJW5 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.72□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Hook2-201ENSMUST00000064495 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Cldn34c3J3QJW5 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cfap97-202ENSMUST00000110376 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cdcp1-201ENSMUST00000039229 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Cldn34c3J3QJW5 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
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