Protein–RNA interactions for Protein: J3KMM7

A630095N17Rik, RIKEN cDNA A630095N17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A630095N17RikJ3KMM7 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm15825-201ENSMUST00000159108 918 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm22175-201ENSMUST00000175007 78 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
A630095N17RikJ3KMM7 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Nutf2-201ENSMUST00000008594 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
A630095N17RikJ3KMM7 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.9 ms