Protein–RNA interactions for Protein: G3UW52

Cldn34a, Claudin 34A, mousemouse

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Length 211 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34aG3UW52 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Cldn34aG3UW52 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
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