Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ63

Vmn1r76, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r76F8VQ63 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Col13a1-205ENSMUST00000105454 3162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Vmn1r76F8VQ63 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Esr1-202ENSMUST00000105588 2733 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Dnase1l2-201ENSMUST00000088506 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Mphosph8-201ENSMUST00000116468 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Camk2b-205ENSMUST00000093355 1973 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Ocln-205ENSMUST00000160859 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Asf1b-201ENSMUST00000005607 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Fam107b-203ENSMUST00000115053 688 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Vmn1r76F8VQ63 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.5 ms