Protein–RNA interactions for Protein: F8VPZ3

Usp32, Ubiquitin-specific peptidase 32, mousemouse

Predictions only

Length 1,604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp32F8VPZ3 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Rogdi-201ENSMUST00000023191 1431 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 A330040F15Rik-202ENSMUST00000224046 1918 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Mettl23-201ENSMUST00000106370 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 AC125206.2-201ENSMUST00000217454 574 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Wdyhv1-203ENSMUST00000226889 394 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Mzb1-201ENSMUST00000025211 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Sebox-201ENSMUST00000001130 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Trim63-201ENSMUST00000030638 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Gm24158-201ENSMUST00000175263 71 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Ino80e-214ENSMUST00000206349 883 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Guca2b-201ENSMUST00000044426 605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Plscr3-202ENSMUST00000108632 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Usp32F8VPZ3 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Cbx6-201ENSMUST00000109623 996 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Lcn6-202ENSMUST00000114197 635 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm13015-201ENSMUST00000118674 204 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Ppt2-202ENSMUST00000166040 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm20650-201ENSMUST00000175690 198 ntTSL 3 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gtdc1-202ENSMUST00000100127 2422 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Mir99ahg-211ENSMUST00000183099 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm2423-201ENSMUST00000074863 733 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Tpm1-214ENSMUST00000113701 1677 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Trnt1-201ENSMUST00000057578 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Hes5-201ENSMUST00000049621 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Usp32F8VPZ3 Gm7901-201ENSMUST00000120430 1597 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.4 ms