Protein–RNA interactions for Protein: F6XVS9

Gm8922, Predicted gene 8922, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8922F6XVS9 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Cdkl3-209ENSMUST00000120374 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm8922F6XVS9 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Ppp2r2c-201ENSMUST00000031003 4088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Islr2-202ENSMUST00000163200 4123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Wnt5b-201ENSMUST00000117171 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm8922F6XVS9 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54 ms