Protein–RNA interactions for Protein: F6VCN9

Gm5861, Predicted gene 5861 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5861F6VCN9 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
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Gm5861F6VCN9 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 9530082P21Rik-202ENSMUST00000181291 1798 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm5861F6VCN9 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms