Protein–RNA interactions for Protein: F6SW83

Gm10477, Predicted gene 10477, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm10477F6SW83 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm43399-201ENSMUST00000202546 2374 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Patz1-202ENSMUST00000093402 3173 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Adam15-204ENSMUST00000107448 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm10477F6SW83 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Smco4-202ENSMUST00000178999 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Smco4-201ENSMUST00000045620 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Lrp11-201ENSMUST00000019931 3386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 H2-K1-201ENSMUST00000025181 1605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gpr88-201ENSMUST00000090473 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Nacc2-201ENSMUST00000028300 6378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Dlx6-202ENSMUST00000160937 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm43697-201ENSMUST00000199637 2581 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Efcab14-204ENSMUST00000106525 2792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Coasy-201ENSMUST00000001806 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Add1-203ENSMUST00000114335 4547 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gm10477F6SW83 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
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