Protein–RNA interactions for Protein: E9Q623

BC051665, cDNA sequence BC051665, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC051665E9Q623 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Thap6-204ENSMUST00000193925 1337 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm26728-202ENSMUST00000203423 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rpl37rt-201ENSMUST00000100847 682 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Cmc2-202ENSMUST00000128304 394 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm26935-201ENSMUST00000182686 519 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Sftpb-204ENSMUST00000183018 1490 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Coq10a-205ENSMUST00000220027 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 AC122301.2-201ENSMUST00000219020 1474 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 2610318N02Rik-201ENSMUST00000093336 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm14493-201ENSMUST00000141174 543 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Snapc2-203ENSMUST00000208316 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gpr146-202ENSMUST00000053120 1040 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 G430095P16Rik-201ENSMUST00000098571 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
BC051665E9Q623 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56 ms