Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Chdh-201ENSMUST00000067620 5690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Pim1-201ENSMUST00000024811 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Otud6b-201ENSMUST00000117268 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Slc16a9-201ENSMUST00000046807 3756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Rai2-202ENSMUST00000112338 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm26852-201ENSMUST00000180691 5751 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Suv39h2-201ENSMUST00000027956 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ispd-202ENSMUST00000220519 3122 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ydjc-203ENSMUST00000115706 3097 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Smyd5-201ENSMUST00000045693 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Fam219a-201ENSMUST00000108049 3296 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Pgbd1E9Q492 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Dnm1-217ENSMUST00000202578 2820 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Lmf1-202ENSMUST00000116641 1858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Pgbd1E9Q492 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms