Protein–RNA interactions for Protein: E9Q373

Vmn1r238, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r238E9Q373 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Klhl26-204ENSMUST00000209567 2615 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Tfdp2-201ENSMUST00000034982 7354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Vmn1r238E9Q373 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pde4d-208ENSMUST00000120671 2455 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r238E9Q373 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r238E9Q373 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Vmn1r238E9Q373 Usp38-201ENSMUST00000042724 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Sept6-203ENSMUST00000115239 1845 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fbxw11-203ENSMUST00000109366 3821 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Lamc1-201ENSMUST00000027752 7622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Grm6-204ENSMUST00000171427 4330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Vmn1r238E9Q373 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
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