Protein–RNA interactions for Protein: E9Q2E9

Krtap11-1, Keratin-associated protein 11-1, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap11-1E9Q2E9 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 AC163637.1-201ENSMUST00000215491 1894 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gadd45gip1-201ENSMUST00000036734 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.57□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35c1-202ENSMUST00000125276 2668 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.72
Krtap11-1E9Q2E9 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.55□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms