Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

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Length 1,324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Ddit4l-201ENSMUST00000053855 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Kif22-201ENSMUST00000032915 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Ccdc171E9Q1U1 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
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Ccdc171E9Q1U1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 2610027K06Rik-203ENSMUST00000140673 2076 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Rcor1-202ENSMUST00000116388 2720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm26664-201ENSMUST00000181140 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ccdc171E9Q1U1 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
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