Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0Q3

2610021A01Rik, RIKEN cDNA 2610021A01 gene, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610021A01RikE9Q0Q3 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rell2-204ENSMUST00000163591 1057 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Enah-204ENSMUST00000111030 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 C2cd2l-201ENSMUST00000065080 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Trim65-201ENSMUST00000067632 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubtf-205ENSMUST00000107119 3013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Pgm1-201ENSMUST00000087324 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Zyx-207ENSMUST00000203652 2605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Mesd-201ENSMUST00000094215 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
2610021A01RikE9Q0Q3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms