Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Bad-203ENSMUST00000113426 740 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Pax5-206ENSMUST00000134968 969 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 1700028J19Rik-203ENSMUST00000206686 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Tspan32-211ENSMUST00000207211 1220 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Ucn-201ENSMUST00000043475 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Odf3l2-201ENSMUST00000095464 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm3002-201ENSMUST00000170480 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm3005-202ENSMUST00000178728 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Fam110a-202ENSMUST00000109863 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rpl34-ps1-201ENSMUST00000121998 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm38225-201ENSMUST00000194001 393 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm10154-201ENSMUST00000084445 354 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Cd82-202ENSMUST00000099696 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 2310011J03Rik-201ENSMUST00000020341 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 AC132317.1-201ENSMUST00000227227 962 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 AI480526-202ENSMUST00000159637 1697 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Tmem109-207ENSMUST00000147699 1096 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Ube2m-208ENSMUST00000165394 1228 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 1700113H08Rik-202ENSMUST00000189456 974 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Hmga1-201ENSMUST00000114888 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Akt2-ps-201ENSMUST00000120718 1449 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm7584-201ENSMUST00000175829 940 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
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Gcn1E9PVA8 Gm3654-202ENSMUST00000210597 472 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Pold4-201ENSMUST00000025773 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gpbar1-201ENSMUST00000077985 1075 ntAPPRIS P1 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Ttll3-206ENSMUST00000204026 1472 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Pebp1-202ENSMUST00000111973 779 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Cd209f-202ENSMUST00000138439 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Cd209f-203ENSMUST00000145007 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Tm2d2-202ENSMUST00000210536 727 ntTSL 3 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Fn3k-202ENSMUST00000092302 1803 ntTSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Pdgfrl-201ENSMUST00000034004 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Gcn1E9PVA8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
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