Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3L3

Trim12c, Tripartite motif-containing 12C, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim12cD3Z3L3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim12cD3Z3L3 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Bcl2l12-201ENSMUST00000003290 1075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Nrbf2-201ENSMUST00000077839 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tmem237-201ENSMUST00000087475 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 AC131187.1-201ENSMUST00000224567 809 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm29683-202ENSMUST00000208511 720 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim12cD3Z3L3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms