Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK2

Safb, Scaffold attachment factor B1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 937 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SafbD3YXK2 Prss23-201ENSMUST00000041761 3228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Cpsf6-207ENSMUST00000176686 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Irak1-204ENSMUST00000114352 3825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gm3045-201ENSMUST00000212844 1825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Klhl11-201ENSMUST00000056665 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Dmpk-201ENSMUST00000032568 2761 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ccnf-201ENSMUST00000115390 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 B4galt3-202ENSMUST00000111313 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Slc8a3-203ENSMUST00000182208 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
SafbD3YXK2 Gtf2ird1-205ENSMUST00000100654 3156 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Efs-201ENSMUST00000022813 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Tfe3-201ENSMUST00000077680 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Poli-202ENSMUST00000121674 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Cdhr5-202ENSMUST00000167263 2628 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Pdlim1-201ENSMUST00000068439 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
SafbD3YXK2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms