Protein–RNA interactions for Protein: D3YXK1

Samd1, Atherin, mousemouse

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd1D3YXK1 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Csrnp1-204ENSMUST00000215916 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Tpbg-202ENSMUST00000098500 3481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ptgs1-201ENSMUST00000062069 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Ccna2-201ENSMUST00000029270 2965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Samd1D3YXK1 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms