Protein–RNA interactions for Protein: D3YV10

Ccdc13, Coiled-coil domain-containing protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc13D3YV10 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gpam-201ENSMUST00000061856 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Eif4g3-203ENSMUST00000084215 8134 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ndst2-202ENSMUST00000223679 3907 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Col5a3-201ENSMUST00000004201 6119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Zbtb14-203ENSMUST00000112676 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Acbd5-203ENSMUST00000114526 3725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Ccdc13D3YV10 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms