Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Kmt5b-208ENSMUST00000113977 6002 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Col2a1-201ENSMUST00000023123 5104 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Edem3-201ENSMUST00000059498 6327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd5-204ENSMUST00000114529 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nipsnap3aB1AWZ3 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms