Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 R3hdm4-202ENSMUST00000171416 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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Gm6880A3KG45 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Slc4a7-201ENSMUST00000057015 8132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gm6880A3KG45 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm6880A3KG45 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm6880A3KG45 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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Gm6880A3KG45 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gm6880A3KG45 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
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